Jadis, le peuple rat et la communauté souris étaient menacés par les scientifiques du laboratoire de NIMH. Jonathan Brisby les avait sauvés, devenant ainsi un héros. Aujourd'hui, Jonathan a rendu son dernier soupir, et sa veuve élève seule leurs enfants. Alors que les souris sont à nouveau menacées, le Grand Hibou fait appel à Timmy, l'un des fils Brisby, pour les sauver.
Dans un monde imaginaire, une jeune adolescente nommée "princesse Mona" vit chez ses parents adoptifs, Goomi et Monseigneur, une vieille ratte et son fils, un rat mâle ventru, tous deux aigris et méchants. Ils habitent dans un vieux manoir taillé dans la pierre, sur une falaise au bord de la mer, à proximité d'une forêt luxuriante et multicolore. Lassée par ces parents peu amènes, Mona, qui ne rêve que d'amis et d'amours, dépérit. Un jour, elle voit apparaître dans sa demeure une petite licorne blanche aux yeux bleus prénommée U, qui vient pour l'aider. U devient la première amie de Mona, qui lui confie ses questionnements plus ou moins profonds ou futiles sur son corps, sa beauté, l'amour, l'avenir.
Meadows, le majordome, quitte après avoir été tourmenté par le chat de la famille gâté, qui trouve qu'il est incapable de survivre seul, surtout après avoir rencontré les souris Hubie et Bertie.
Mickey est un vendeur de hot dogs dans une fête foraine. Mais ses hot dogs sont presque vivants et ils essayent de se comporter comme de véritables chiens auprès de l'acheteur devenu leur nouveau propriétaire. L'humour du film découle principalement de ce concept.
Le chat Kat Nipp vit dans une demeure où il passe une grande partie de son temps à boire de l'alcool. Sa présence empêche les souris de la maison de vivre. Kat Nipp s'absente pour aller chasser au dehors. Une armée de souris profitent de cette absence pour envahir la maison à la recherche de nourriture. Parmi les souris, Mickey et Minnie tentent de transformer le regroupement en une fête.
Dans la première histoire, Riri, Fifi et Loulou fêtent Noël avec leur famille. Ils font à une étoile le vœu que Noël dure éternellement. Au bout d'un certain temps, les neveux de Donald commencent à en avoir assez de manger de la dinde tous les soirs et d'ouvrir les mêmes cadeaux tous les matins. Ils décident alors pour s'amuser de faire des farces. Ils cachent une dinde vivante dans le plat de Daisy, ils lancent leurs jouets sur Donald qui arrive avec le petit déjeuner et à la fin de la journée se repentent en voyant la carte que Donald et Daisy avaient écrit à leur attention. Ils prennent la décision de très bien se conduire le lendemain et passent un Noël magique. Le jour suivant ils réalisent avec joie que c'est le 26 décembre.
Le film comprend plusieurs dessins animés regroupés sous la forme d'un spectacle donné lors d'une fête d'Halloween dans la salle du Club de Mickey. Plusieurs des grands méchants des films et séries Disney prennent le contrôle du club par la force et la magie noire surtout dirigée par Jafar aidé entre autres du Capitaine Crochet, Cruella d'Enfer, Hadès, Ursula, Pat Hibulaire, Shenzi, Banzaï et Ed le grand méchant loup, La Reine de cœur, Maléfique, ou encore Chernabog. Pendant un moment "Disney tous en boite" devient "Le club des méchants".
Ce film arrive des années après les exploits légendaires de D'Artagnan, Athos, Porthos et Aramis. La trame du film reprend un thème proche des romans d'Alexandre Dumas mais éloigné de l'histoire de France. Minnie a succédé au roi Louis XIII et Daisy est la dame de compagnie de la reine.
Mickey est un violon soliste qui interprète plusieurs titres. Les morceaux sont l'ouverture de Guillaume Tell de Rossini, la Rêverie de Robert Schumann, et la Rhapsodie hongroise No. 2 de Franz Liszt.
Mickey joue un morceau de blues au piano tandis que Minnie chante. Ils sont accompagnés d'un orchestre, d'abord caché, qui se dévoile avec un morceau plus rythmé. Le groupe de 9 musiciens comprend Pluto au trombone, Horace aux percussions, Clarabelle à la basse tandis que Mickey fait un solo de clarinette.
Mickey est aux commandes d'une énorme pelle mécanique sur le chantier d'un bâtiment. Minnie arrive sur le chantier dans une charrette tirée par Pluto qui lui sert à vendre des paniers-repas aux ouvriers (à 15 cents l'un). On découvre une foule d'ouvriers tandis que Minnie grimpe à l'ossature du bâtiment. Elle perd son chapeau. Mickey le rattrape avec la pelle et lui rend. En faisant quelques pas de danse pour montrer son acceptation de la gratitude de Minnie, il lance de la terre et perce le plan que tient Pat Hibulaire, contre-maître du chantier.
Mickey est à la tête d'un orchestre qui joue en plein air. L'orchestre se compose d'entre autres de Dingo (à la clarinette) de Gideon Goat (au trombone), Clarabelle Cow (à la flûte), Horace Horsecollar (aux percussions), Peter Pig (à la trompette) et Paddy Pig (au tuba).
Mickey, Donald et Dingo sont des pompiers et tent de combattre les incendies. Une maison du voisinage prend feu. Le trio se précipite dans la maison et tente de porter secours à ses habitants. L'un d'eux est Clarabelle qui chante dans sa baignoire. Elle ne croit pas à l'incendie et refuse l'assistance. Le trio décide de prendre Clarabelle avec sa baignoire pour la sauver.