En 2293, les officiers de Starfleet à la retraite James T. Kirk, Montgomery Scott et Pavel Chekov sont invités à l'inauguration du nouveau vaisseau : l’Enterprise NCC-1701-B. Lors de la parade le navire reçoit un appel de détresse de deux vaisseaux transportant des réfugiés El-Aurian, dont la planète vient d'être ravagée par les Borgs, pris au piège dans le Nexus, un ruban énergétique mystérieux. L'opération de sauvetage tourne mal : seulement 47 personnes sauvées. Parmi elles un scientifique El-Aurian, Tolian Soran. Si l'Enterprise B est sauvée, le capitaine Kirk est porté disparu et considéré comme mort au combat.
Telly Paretta croit avoir un fils, Sam, qui est décédé dans un crash d'avion. Son époux Jim, quant à lui, dit qu'ils n'ont jamais eu d'enfant. Munce, son psychologue, croit qu'elle imagine une vie qui n'a jamais existé et lui recommande de suivre un traitement au sein d'un hôpital. Elle fait la rencontre d'un homme (Ash), et avance que celui-ci est le père de Lauren, une amie de son présumé fils disparu. Réfugiée chez Ash, Telly trouve des preuves de l'existence de Lauren. Malgré cela, Ash soutient n'avoir jamais eu d'enfant et appelle la police. Telly est arrêtée par deux agents fédéraux. Au moment où les agents voulaient l'embarquer, Ash se souvient d'avoir eu une fille et permet à Telly d'échapper à la NSA. Par la suite, elle rencontre son mari Jim, mais il s'avère qu'il ne se souvient plus d'elle.
Lorsque Sil, hybride humaine/extraterrestre d'une dizaine d'années s'échappe du lieu où elle était en observation dans les laboratoires du gouvernement américain à Dugway dans l'Utah, le scientifique Xavier Fitch engage un tueur du gouvernement, un médium, une biologiste et un anthropologue pour la trouver. Ils la retrouvent quelques jours plus tard, devenue une jeune femme d'une grande beauté à Los Angeles et mettent au jour avec horreur ses intentions : s'accoupler avec des hommes qui ne se doutent de rien et engendrer ainsi sa progéniture pour détruire l'humanité.
Le capitaine Jean-Luc Picard et son équipage doivent commettre l'irréparable pour protéger le secret de la jeunesse éternelle d'un peuple extraterrestre, les Ba'ku contre une autre race extraterrestre et contre la Fédération elle-même.
La Terre subit une invasion extraterrestre. les humains nomment les extraterrestres « les Autres ». Le plan d'invasion des Autres pour s'approprier la Terre se déroule en plusieurs étapes. Les « Vagues » correspondent aux différentes étapes. La première vague est une impulsion électromagnétique qui détruit toute source électrique et les composants électroniques. Cassie Sullivan, est une américaine de 17 ans. Elle a un frère Sammy plus jeune. La deuxième vague est un gigantesque tremblement de terre provoquant des tsunamis et des tempêtes détruisant les infrastructures et les villes. La troisième vague est une épidémie mondiale dérivée de la grippe aviaire. La mère de Cassie, infirmière, tente de secourir les malades infectés. Elle est contaminée et meurt. Après avoir enterré sa femme, le père de Cassie décide de quitter leur maison pour aller se réfugier dans un camp de survivants dans la forêt. Le père de Cassie lui donne un pistolet pour qu'elle puisse se défendre. Un détachement de l'armée arrive au camp. Le colonel annonce que la quatrième vague de l'invasion des Autres pour exterminer les humains survivants a débuté. Les soldats vont emporter les enfants dans des bus vers une base militaire pour les mettre en sécurité, puis reviendront chercher les adultes. Dans le bus, Sammy s'aperçoit qu'il a oublié son ours en peluche. Cassie descend du bus, retourne en courant dans la tente, récupère le nounours de Sammy sur son lit et retourne vers le bus. Le bus démarre. Cassie court après le bus en vain. Le colonel fait réunir les adultes dans une salle et leur explique que les Autres ont pris possession de certains humains.
Tout est normal sur la planète 51. Le ciel est bleu, les habitants sont vert pomme et les Cadillacs volent. Lorsque Chuck, un astronaute venant de la planète Terre, aussi futé qu'une huître, y déboule avec sa fusée, les habitants s'enfuient en hurlant.
Durant le voyage-retour du cargo spatial Nostromo après une mission commerciale de routine, l'équipage, cinq hommes et deux femmes plongés en hibernation depuis dix mois sont tirés de leur léthargie plus tôt que prévu par l'ordinateur de bord du vaisseau. Ce dernier a en effet capté des signaux sonores dans l'espace et, du fait d'une clause attenante à leur contrat de navigation, l'équipage du vaisseau est tenu de vérifier tout indice de vie extraterrestre.
En un quart d'heure, la vie du Britannique Arthur Dent (nommé Arthur Accroc dans la traduction française du livre) est bouleversée : sa maison va être détruite pour être remplacée par un échangeur routier, et la Terre va également être détruite par les Vogons pour créer une voie express hyperspatiale. Il est sauvé par son ami Ford Prefect (en français Ford Escort), un extraterrestre auto-stoppeur.
On signale l'arrivée massive sur terre de Martiens à bord d'innombrables soucoupes volantes. Dans une langue inconnue et d'une voix nasillarde ils diffusent la nouvelle sur toutes les télévisions du globe. Le Président des États-Unis, James Dale, fait alors une annonce en direct afin d'entrer en contact avec eux. Un scientifique invente une machine qui permet de traduire leur langue. Ils annoncent qu'ils vont atterrir dans le désert du Nevada, avec un message de paix. C'est la joie aux États-Unis. Un important dispositif est mis en place pour leur arrivée. La foule est invitée à se rassembler sur le site pour assister à ce premier contact extra-terrestre historique. En fait, les Petits Hommes Verts se moquent de cet accueil et de la naïveté américaine. Ils viennent en réalité prendre possession de notre planète en atomisant la populace, les militaires et le Congrès grâce à leur pistolet-désintégrateur, redoutable arme de poing. Bientôt ce n'est pas qu'aux États-Unis qu'ils prennent pied, mais partout à travers le monde. Poursuivant leur œuvre de mort, ils finissent par tuer les présidents américain et français. Par ailleurs ils se révèlent d'impitoyables observateurs de notre mode de vie intime dont ils se gaussent avec une ironie féroce. Malheureusement pour eux, alors que la victoire leur est acquise sur toute la planète, un jeune Américain et sa grand-mère leur découvre une faiblesse qui va avoir raison d'eux : ils sont allergiques au yodel (en particulier ceux de Slim Whitman dans la chanson Indian Love Call). Il ne reste plus qu'à diffuser partout cette musique qui les anéantit instantanément.
Un météore s'écrase dans le désert près de Glen Canyon, Arizona. Le professeur de collège Ira Kane (David Duchovny) et son collègue, le professeur de géologie Harry Block (Orlando Jones) se rendent sur les lieux pour l'étudier. Ils rencontrent Wayne Grey (Seann William Scott), un pompier stagiaire dont la voiture a été endommagée lors de l'impact et découvrent le météore profondément enfoncé dans un réseau de tunnels souterrains. Les deux scientifiques prélèvent un échantillon de l'étrange liquide bleu qui suinte du météore. Ira découvre que le liquide contient des êtres unicellulaires extraterrestres se multipliant exponentiellement et évoluant de l'équivalent de millions d'années d'évolution en quelques minutes. Le lendemain, Ira et Harry emmènent la classe de science sur le site du météore et y trouvent une forme de vie plus évoluée composée de champignons évolués convertissant l'atmosphère et de vers plats. Ils découvrent par la suite que ces vers se reproduisent rapidement par mitose.
En 1987, un vaisseau spatial extraterrestre arrive à proximité de la Terre et largue un module qui entre dans l'atmosphère de la planète, celui-ci atterrissant en Amérique centrale.
Deux nerds britanniques se rendent aux États-Unis pour le Comic-Con. Ils parcourent ensuite les lieux « mythiques » des amateurs d'ufologie. Sur leur route, ils découvrent un alien nommé Paul, échappé de la Zone 51, où il vivait caché depuis soixante ans. Paul les convainc de l'emmener avec eux et de l'aider à quitter la Terre, mais ils sont poursuivis par trois agents du FBI ainsi que le père d'une fille qu'ils rencontrent durant leur périple…
Praxis, une lune minière klingonne et centre stratégique, explose, mettant à mal les fondations de l'empire klingon. Le chancelier du Haut Conseil klingon, Gorkon, choisit de normaliser les relations avec la Fédération des planètes unies et de mettre fin à une guerre larvée de soixante-dix ans.
En 2285, l’USS Enterprise reçoit un appel de détresse venant d'un vaisseau terrien, le Kobayashi Maru, provenant de l'intérieur de la zone neutre. Le commandant de l’Enterprise, le lieutenant Saavik, décide d'enfreindre le traité de paix avec les Klingons pour sauver l'équipage en péril. Il s'avère que l'appel de détresse était un piège, et des vaisseaux de guerre klingons attaquent l’Enterprise et finissent par le détruire.
Galaxy Quest est une série télévisée de science-fiction mythique qui s'est arrêtée vingt ans auparavant. Toutefois les acteurs n'ont pu se détacher de leur rôle et multiplient les petits boulots (conventions, inaugurations de supermarchés) pour gagner leur vie. Un jour, les Thermiens, de la nébuleuse Klathu, captent la série et pensent se trouver devant des documents d'archives retraçant l'histoire de la Terre. Ils demandent alors aux acteurs de Galaxy Quest de leur venir en aide, car ils sont aux prises avec un terrifiant chef de guerre.