Contrairement aux autres médias de Sonic The Hedgehog, le cadre de ce film est le monde de Planet Freedom, divisé en deux domaines distincts: Le Pays du Ciel (Land of Sky) et le Pays des Ténèbres (Land of Darkness).
Ogami Ittō, un samouraï servant le shogun comme « Kogi Kaishaku-nin » (bourreau officiel) est la cible d’un complot du clan Yagyū pour accaparer son poste et le remplacer par un membre de leur propre famille. Lorsque sa femme est assassinée et que des éléments de preuve apparaissent visant à montrer qu’il comploterait contre le Shogun, le code du Bushido lui impose de commettre le seppuku. Au lieu de cela, il défie les ordres du Shogun et prend les armes accompagné de son jeune fils contre ses ennemis, devenant un assassin à embaucher.
Un policier à Yokohama tue un témoin lors d’une enquête sur la drogue. Il s'enfuit à la campagne et pour échapper à son passé pendant plusieurs années, avant de retrouver la femme qu'il aimait mariée à son ex-partenaire. Il cherche des réponses à son passé troublé, sachant que son inévitable destin est plus ou moins scellé.
Shin est un lycéen ordinaire qui vit à Tokyo. Un jour, il rencontre un garçon nommé Jin, parfaitement semblable à lui, qui prétend venir d'un autre monde. Selon Jin, un monde parallèle existe, où règne une princesse malfaisante, Kotoko. Jin s'est rendu à Tokyo pour tuer le double de Kotoko, qui se trouve être la meilleure amie de Shin, Kotori.
Le détective débutant Jurre de Cock a rejoint la police d’Amsterdam en 1980. Il se retrouve avec son partenaire Montijn dans un complot impliquant une possible attaque terroriste le jour du couronnement de la reine.
À la frontière entre la Colombie, le Brésil et le Pérou (la Tres Fronteras), cinq amis réunis vont voir leur loyauté remise en question lorsqu'ils doivent faire tomber un baron de la drogue sud-américain. Ce qui ne sera pas sans de très lourdes conséquences.
Sarah est une spationaute qui s'entraîne avec acharnement au Centre spatial de Cologne, unique femme au milieu des astronautes européens. Elle vit seule avec sa fille de 8 ans, Stella, qu'elle couve d'un amour inquiet, se sentant coupable de ne pas pouvoir lui consacrer plus de temps. Quand Sarah est choisie pour partir à bord d'une mission spatiale d'un an, baptisée Proxima, sa vie et celle de Stella sont bouleversées.
New York, Tokyo et Mumbai ont tous leur propre vie nocturne. Téhéran aussi, un monde souterrain nocturne pas comme les autres - une jeune fille à la recherche de son bonheur dans le chaos de ce monde affamé monte dans un taxi de nuit, ignorant comment sa vie va changer à jamais.
En 1904, Oslo a subi un tremblement de terre d’une intensité de 5,4 sur l’échelle de Richter. Le séisme a entraîné une destruction importante. Mais heureusement, aucune vie humaine n’a été perdue. Pourtant, de nos jours, les études géologiques montrent que le danger d’un nouveau séisme plus important peut être réel.
Pendant l'été 1882, Charlotte Locktown et son époux David, un couple de britanniques aisés, venus s'installer dans une île au sud de la Nouvelle-Zélande, fondent une famille en accueillant leur premier enfant. Quelques mois plus tard, un soir, trois inconnus pénètrent dans leur maison, tuent David et kidnappe leur petit garçon. Dévastée mais déterminée, et face à l'impuissance de la police, Charlotte décide de retrouver son enfant toute seule. Après avoir reçu une photo de lui avec une demande de rançon, elle participe à la ruée vers l'or qui s'est emparée du pays afin d'obtenir des indices qui la mèneront vers l'homme responsable de la mort de son époux et de l'enlèvement de son fils.